DART(Data Assimilation Research Testbed)是一个数据同化的集合工具，是由NCAR提供支持的集合数据同化社区版工具，其支持提供了大多数模式数据同化接口。
安装
DART的编译依赖于make和mkmf两个工具，make是一个非常常用的工具，其记录了各源码文件间的依赖关系，通常由用户自定义。mkmf是一个perl脚本，用来生成make输入文件和示例namelist文件input.nml.program_default。
mkmf需要两个输入文件，第一个模版文件定义了特定F90编译器所需要的命令，也包含了DART系统所需要的预编译工具指向的目录。此模版需要根据所使用的系统进行修改。第二个模版文件是DART所需要的path_names文件，无需更改。mkmf使用上述两个文件生成Makefile，成功之后即可使用make进行编译。
构建和自定义mkmf.template文件
DART/build_templates目录下有很多模版文件，文件后缀为系统和编译器名称。
自定义path_names_*文件
每个模式的work目录下都提供了一些path_names_*文件，比如DART/models/lorenz_63/work，这些文件一般不需要自定义修改。
构建Lorenz_63 DART项目
所有的DART程序都可以使用相同的方式编译。每个模式目录中都有一个work目录，其中包含了用于构建可执行程序的文件。下例展示了如何为lorenz_63创建两个可执行程序：preprocess和obs_diag。preprocess的构建和运行是用于创建源码支持特定的观测。按照如下方式编译：
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| cd DART/models/lorenz_63/work
./mkmf_preprocess
make
./preprocess # 用于生成../../../assimilation_code/modules/observations/obs_kind_mod.f90文件，否则会报错
./mkmf_obs_diag
make
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目前work目录下已经有一些DART可执行文件，Lorenz_63模式有7个mkmf_xxxxxx文件，具体描述如下：
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Program Purpose
preprocess creates custom source code for just the observations of interest
create_obs_sequence specify a (set) of observation characteristics taken by a particular (set of) instruments
create_fixed_network_seq specify the temporal attributes of the observation sets
perfect_model_obs spinup, generate "true state" for synthetic observation experiments, ...
filter perform experiments
obs_diag creates observation-space diagnostic files to be explored by the MATLAB® scripts.
obs_sequence_tool manipulates observation sequence files. It is not generally needed (particularly for low-order models) but can be used to combine observation sequences or convert from ASCII to binary or vice-versa. Since this is a specialty routine - we will not cover its use in this document.
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quickbuild.csh脚本可用于创建所有的可执行文件，而且可以提供选项构建mpi版本。
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| cd DART/models/lorenz_63/work
./quickbuild.csh -nompi
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简单运行测试
DART/models/lorenz_63/work目录下提供了一些输入文件，可用于进行简单的测试：使用20个集合成员同化50天逐6小时的观测。运行perfect_model_obs和filter可以得到已知结果的对比结果。
初始条件和观测序列文件为ASCII格式，不存在移植的问题，但是从ASCII转换到机器二进制可能会存在一些问题。对于高度非线形模式，初始条件的微小差异会导致模式结果的不同。
Manhattan发行版使用netCDF文件作为输入文件格式，使用ncgen可进行转换。当转换完成后，执行perfect_model_obs和filter即可：
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| ncgen -o perfect_input.nc perfect_input.cdl
ncgen -o filter_input.nc filter_input.cdl
./perfect_model_obs
./filter
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以下是输出文件：
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| from executable "perfect_model_obs"
perfect_output.nc a netCDF file containing the model trajectory ... the 'truth'
obs_seq.out The observations (harvested as the true model was advanced) that were assimilated.
from executable "filter"
preassim.nc A netCDF file of the ensemble model states just before assimilation. This is the prior.
filter_output.nc A netCDF file of the ensemble model states after assimilation.
obs_seq.final The observations that were assimilated as well as the ensemble mean estimates of the 'observations' - for comparison.
from both
dart_log.out The run-time log of the experiment. This grows with each execution and may safely be deleted at any time.
dart_log.nml A record of the input settings of the experiment. This file may safely be deleted at any time.
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如果修改了input.nml文件中的设置，输出文件可能会发生变化。
DART/documentation/tutorial 文档是学习DART和集合数据同化的非常有用的资料。
构建DART-WRF
DART也提供了WRF模式的同化模块，进入DART/models/wrf/work 目录可以按照lorenz_63 的构建方式进行编译，编译之前需要更改build_templates/mkmf.template 文件，使用intel编译器，并行库使用impi，编译选项更改为：
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| MPIFC = mpiifort
MPILD = mpiifort
FC = ifort
LD = ifort
FFLAGS = -O2 $(INCS)
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编译前执行 echo $NETCDF 查看是否设置了netcdf环境变量，如果未设置，需要在 mkmf.template 文件中显示给定netcdf的路径
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| INCS = -I$(NETCDF)/include
LIBS = -L$(NETCDF)/lib -lnetcdff -lnetcdf
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上述使用的是netcdfv4.3.0版本，如果使用的是比较老的netcdf版本，上述 LIBS 可能需要更改为
LIBS = -L$(NETCDF)/lib -lnetcdf
然后进入DART/models/wrf/work目录，执行quickbuild.csh脚本，然后编译所有可执行程序，默认编译为并行版。
如果没有出现错误，则表示所有可执行程序都编译成功，最后会出现所有可执行程序均编译成功的提示。
更新记录
2019.05.15 更新DART安装及WRF部分编译
