ncatted可以编辑netCDF文件的属性。ncatted可以添加，创建，删除，更改和重写属性。ncatted可以将每个操作应用到文件中的每个变量。ncatted主要用于写属性。如果仅是读取属性信息， 可以使用ncks -m -M。

因为ncatted会重复使用，所以可能会增加history全局属性的大小，可以使用-h选项放置将操作记录自动添加到输出文件的history全局属性。

当使用ncatted改变_FillValue属性时，会改变相应的缺失值。如果文件内部缺失值为浮点数形式，比如1.0e36，在不同的机器之间，可能会产生不兼容的缺失值。这使得ncatted从不同的机器改 变文件中的缺失值时能够将文件联系起来而不会损失信息。更过信息见Missing Values。

为了使用ncatted，必须要理解描述属性变化的结构的含义。att_dsc是-a选项的参数，每个att_dsc都包含了5个元素，即att_dsc = att_nm, var_nm, mode, att_type, att_val

  • att_nm：属性名，从V4.5.1开始，接受正则表达式。
  • var_nm：变量名，也接受正则表达式，global和group也有各自的含义。
  • mode：编辑模式缩略名
    • a：添加，如果不存在，则创建
    • c：创建，如果不存在，则创建，否则，不改变已存在的属性
    • d：删除，如果不存在，则不执行删除操作。如果att_nm留空，和指定变量相关的所有属性都将被删除。当选择了删除模式时，att_type和att_val将是多余的，可以留空。
    • m：更改，如果有，则更改，没有，则不执行更改操作。
    • n：如果存在，则添加到已有属性值之后，否则，不指定操作。
    • o：重写，默认模式。
  • att_type：属性类型缩略名
    • f：浮点数，即netCDF的NC_FLOAT类型
    • d：双精度浮点数，NC_DOUBLE
    • i, l：整数，NC_INT
    • s：短整型，NC_SHORT
    • c：字符，NC_CHAR
    • b：字节，NC_BYTE
    • ub：无符号字节，NC_UBYTE
    • us：无符号短整型，NC_USHORT
    • u, ui, ul：无符号整型，NC_UINT
    • ll, int64：整型，NC_INT64
    • ull, uint64：无符号整型，NC_UINT64
    • sng, string：字符串，NC_STRING
  • att_val：属性值

示例

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ncatted -a isotope,'^H2O*',c,s,'18' in.nc # 为变量名中包含H2O的添加 isotope 属性
ncatted -a '.?_iso19115$','^H2O*',d,, in.nc  # 删除变量中包含H2O的属性值以_iso19115结尾的属性
# Overwrite units attribute of specific 'lon' variable
ncatted -O -a units,/g1/lon,o,c,'degrees_west' in_grp.nc
# Overwrite units attribute of all 'lon' variables
ncatted -O -a units,lon,o,c,'degrees_west' in_grp.nc
# Delete units attribute of all 'lon' variables
ncatted -O -a units,lon,d,, in_grp.nc
# Overwrite units attribute with new type for specific 'lon' variable
ncatted -O -a units,/g1/lon,o,sng,'degrees_west' in_grp.nc
# Add new_att attribute to all variables
ncatted -O -a new_att,,c,sng,'new variable attribute' in_grp.nc
# Add new_grp_att group attribute to all groups
ncatted -O -a new_grp_att,group,c,sng,'new group attribute' in_grp.nc
# Add new_grp_att group attribute to single group
ncatted -O -a g1_grp_att,g1,c,sng,'new group attribute' in_grp.nc
# Add new_glb_att global attribute to root group
ncatted -O -a new_glb_att,global,c,sng,'new global attribute' in_grp.nc

  • 删除指定全局属性

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    ncatted -a global_att,global,d,, filename

  • 从一个文件拷贝全局属性

    1

    ncks -A -x one_file another_file

  • 重命名全局属性

    1

    ncrename -a .global@.Convention,Conventions in.nc

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参考链接

  1. https://sourceforge.net/p/nco/discussion/9830/thread/c42c68fc/
  2. https://linux.die.net/man/1/ncatted
  3. http://nco.sourceforge.net/nco.html#xmp_att_glb_cpy
  4. http://nco.sourceforge.net/nco.html#ncrename-netCDF-Renamer

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更新记录

  • 2019.04.12 初版

  • 2020.01.17 添加更多操作